Исследование позволяет выявить антитела к компонентам  цитоплазматических гранул нейтрофилов и моноцитов, что играет важную роль в патогенезе аутоиммунного процесса - гранулематоза Вегенера (васкулит мелких сосудов, проявляющийся обычно пневмонией, синуситами и гематурией). Они могут быть обнаружены и при других формах васкулитов, в частности при узелковом периартериите.

Антитела к циклическому цитруллинированному пептиду (anti-CCP)   -  группа аутоантител, распознающих антигенные детерминанты белков, содержащих аминокислоту цитруллин. Наличие антител к циклическому цитруллинсодержащему пептиду – очень ранний информативный маркер ревматоидного артрита, которые появляются в крови за 1 – 2 года до появления первых признаков заболевания.  Исследование обладает высокой  диагностической значимостью для раннего выявления этого аутоиммунного заболевания.

Антиядерные антитела, антитела IgG (SS-A/Ro, SS-B/La, RNP70, SM, RNP/Sm, Scl-70, к центромере B и Jo-1)  -  маркеры целого ряда заболеваний соединительной ткани, при развитии которых аутоантитела вырабатываются против различных клеточных структур ядра и цитоплазмы. Характерным признаком многих ревматических заболеваний является выработка одного или нескольких антинуклеарных антител.  Наличие антител к двуспиральной ДНК, односпиральной ДНК, ядерному нуклеопротеину (RNP) и Смит-антигену (Sm) связаны с системной красной волчанкой. Антитела к двуспиральной ДНК обнаруживаются в активной фазе системной красной волчанки, при этом их сывороточная концентрация коррелирует с тяжестью заболевания. Антитела к Jo-1 наблюдаются при полимиозите и дерматомиозите. Антитела к склеродерма-ассоциированному антигену (Scl-70) и центромере встречаются у пациентов с прогрессирующим системным склерозом.

Кальпротектин  – надежный и удобный маркер воспаления слизистой кишечника, представляет собой Ca2+ – cвязывающий белок, который вырабатывается только активированными лейкоцитами (чаще всего – нейтрофилами, реже – моноцитами и макрофагами). При развитии воспалительного процесса в очаг воспаления мигрируют нейтрофилы, основная функция которых – локализация воспалительного очага. В реализации этого процесса принимает участие и кальпротектин, секре-тируемый в межклеточное пространство при запуске защитных механизмов. Также туда попадает кальпротектин, высвобождающийся из погибших лейкоцитов. При хронических воспалительных заболеваниях кишечника молекулы кальпротектина попадают в просвет кишечника и могут быть обнаружены в кале. Уровень фекального кальпротектина коррелирует с количеством нейтрофилов в очаге воспаления и отражает степень тяжести воспаления.